凍干機的使用相對常規的凍干方法，許多熱敏性的物質不會發生變性或失活。在低溫下干燥時，物質中的一些揮發性成分損失很小。由于在凍結的狀態下進行干燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。由于物料中水分在預凍以后以冰晶的形態存在，原來溶于水中的無機鹽類溶解物質被均勻地分配在物料之中。升華時，溶于水中的溶解物質就析出。這避免了一般干燥方法中因物料內部水分向表面遷移所攜帶的無機鹽在表面析出而造成表面硬化的現象。

　　凍干機主要由控制系統、真空系統、制冷系統、循環系統組成，醫藥冷凍干燥機除以上組成部分外，還有液壓系統、在位清洗系統和在位滅菌系統等。作為無菌冷凍干燥制劑生產過程中的關鍵設備，由于藥品的特殊性，因此相關部門對冷凍干燥機的材質、性能等均做了明確的規定。現在的制藥凍干機雖然已經符合生產要求，但從經濟效益、產品質量、生產操作等方面考慮還存在部分不足，主要的一點就是真空度太高，不利于產品升華。

　　在使用該凍干機的時候，一定要注意以下三點相關事項，以免出現不必要的麻煩：

　　1、結晶

　　在預先冷卻時箱內有許多水分結霜于隔板上，產品進箱時，霜從隔板中掉入產品中結晶中心，從而使產品結晶。產品預先加塞或加蓋，或者產品進箱后再開機預凍。實現凍干后自動壓塞，同時期待著此設備能夠解決不提前半壓塞，解決結晶問題。

　　2、掉底

　　掉底發生在預凍抽空階段，一般是未凍實的液體于真空下快速蒸發，沸騰放熱時發生。放熱時產品本身溫度急降，達到共晶點溫度，于瓶底接觸的擱板層并沒有以上蒸發冷凍特性，玻瓶承受不了短時間的如此大的溫度。所以預凍階段要凍實。

　　3、噴瓶現象

　　噴瓶是影響凍干制劑外觀質量的重要因素，噴瓶的原因主要在三個方面，藥液中的氣泡、預凍、干燥速率。