真空凍干機在生物制品方面、西藥生產中、中藥生產中、醫療方面、食品的凍干的應用等。工作時，將物料架從冷阱腔中提出，置于備用的活動硬質塑料圓盤上（均放置在冷阱腔上方），然后將有機玻璃罩罩好，若采用壓蓋裝置凍干物料，物料預凍好后迅速將物料從預凍架轉移到壓蓋裝置的擱板上，然后將壓蓋用的有機玻璃罩罩好。

　　真空凍干機的整個凍干過程都是在低溫低壓環境下進行，凍干方式能有效地保留凍干產品的熱敏性成分及原有生物特性。凍干過程是一個由低溫逐漸緩慢升溫的過程，如果升溫過快、溫度過高，容易導致較終凍干產品外觀崩塌、品相不佳，凍干過程分為：預凍、升華干燥、解析干燥等三個階段。

　　真空凍干機的工作是在真空狀態下，從固態的樣品中直接將溶劑升華為氣態而達到干燥的目的。由于是在常溫甚至低溫狀態下干燥樣品，所以不影響其樣品的生物活性，并且處理后的樣品呈酥松多孔狀態，易于溶解。所以凍干是保存生物活性樣品的好方法。

　　真空凍干機的物料預凍：

　　物料的預凍是冷凍干燥過程的關鍵步驟，預凍過程的好壞直接影響冷凍干燥產品的品質。物料預凍過程基本可分為慢速冷凍、快速冷凍，用戶可根據具體需要靈活操作設備，達到物料的有效預凍。如：

　　1.慢速冷凍：預先準備好的物料放入冷阱，蓋好保溫蓋，打開壓縮機，預凍開始；

　　2.快速冷凍：先行打開壓縮機，待冷阱腔溫度下降到一定溫度，再將預先準備好的物料放入冷阱，預凍開始。